食用菌與一般農(nóng)作物不一樣，其生育期短，組織柔嫩，投藥能力差，且子實(shí)體易于積累化學(xué)農(nóng)殘毒，影響食用菌的風(fēng)味和人的身體健康。其次，由于食用菌與大多數(shù)雜菌及病原菌具有同源性，且目前還沒(méi)有高效的選擇性殺菌劑可供使用。因此食用菌病蟲(chóng)毒及雜菌的防治應(yīng)該以預(yù)防為主，強(qiáng)調(diào)環(huán)境控制和物理防治相結(jié)合的綜合防治辦法。
       一、防治原則 
       1、預(yù)防為主，綜合防治； 2、選用抗病、蟲(chóng)害品種及進(jìn)行合理栽培管理； 3、組織較完整的防治系統(tǒng)，減少或控制病害來(lái)源。
       二、注意事項(xiàng) 
       1、子實(shí)體生長(zhǎng)期短，又直接食用，嚴(yán)禁使用劇毒農(nóng)藥。 2、需化學(xué)藥劑輔助治療時(shí)，一定要選用有產(chǎn)品登記號(hào)的高效、低毒、低殘留藥劑，并做到適時(shí)、適量合理使用。 3、出菇期間禁用化學(xué)藥劑防治。 
       三、綜合防治措施 
       1、菇場(chǎng)設(shè)計(jì)科學(xué) 從防止有害生物角度出發(fā)，把原料庫(kù)、配料廠、肥料堆積場(chǎng)等感染源區(qū)與菌種室、接種室、培養(yǎng)室、出菇棚等易染區(qū)隔離；防止材料、人員、廢料等從污染出流動(dòng)到易染區(qū)；有條件的菇場(chǎng)，應(yīng)將培訓(xùn)室與出菇棚分開(kāi)，以減少培養(yǎng)期污染。 
       2、環(huán)境衛(wèi)生清潔 搞好環(huán)境衛(wèi)生是有效防治多種有害生物的重要手段之一，也是其他防治技術(shù)獲得成功的基礎(chǔ)。做好日常清潔衛(wèi)生工作，將廢棄物和污染物及時(shí)燒毀或沒(méi)埋；及時(shí)清理周邊環(huán)境中的雜草、積水及各種有機(jī)殘?bào)w，避免病蟲(chóng)滋生；避免使用不清潔的污水；周時(shí)控制栽培場(chǎng)人員流動(dòng)。此外，每一季栽培結(jié)束后，應(yīng)徹底清理菇場(chǎng)。 
       3、選用適宜品種 選用抗病蟲(chóng)性、抗逆性強(qiáng)的菌種；同時(shí)，使用菌齡適宜的菌種，并通過(guò)適當(dāng)加大播種量，增強(qiáng)抗病蟲(chóng)能力。 
       4、配料慎重合理 生產(chǎn)選用新鮮、無(wú)變質(zhì)的原材料；配料時(shí)勿添加過(guò)多糖、糧類營(yíng)養(yǎng)，拌料時(shí)要求偏弱堿性。嚴(yán)格滅菌操作，避免滅菌不徹底造成的批量污染。
       5、實(shí)施輪作換茬 對(duì)于發(fā)生過(guò)嚴(yán)重性病害、蟲(chóng)害的出菇棚或栽培場(chǎng)所應(yīng)采取換茬或輪作的方法，避免病蟲(chóng)害再次爆發(fā)。 
       6、物理防治較好 菇場(chǎng)設(shè)施的門窗要安裝防蟲(chóng)網(wǎng)、紗窗等；出入菇房隨手關(guān)門，防止蠅、蚊成蟲(chóng)飛入產(chǎn)卵。發(fā)菌期間防止溫差過(guò)大或過(guò)高等不利于菌絲生長(zhǎng)的情況出現(xiàn)；出菇期間防止高溫高溫，有利于減少病害發(fā)生。此外，人工捕殺、人工誘殺等措施也是有效的蟲(chóng)害防治辦法。 
       7、生物防治最佳 生物防治技術(shù)是實(shí)現(xiàn)無(wú)公害食用菌生產(chǎn)的關(guān)鍵技術(shù)，雖然尚處于技術(shù)起步階段，但符合發(fā)展要求，前景樂(lè)觀。目前投入使用的產(chǎn)品種類有：細(xì)菌制劑，如蘇云金桿菌用于防治螨類、蠅蚊、線蟲(chóng)等；植物制劑，如魚(yú)藤精、煙草浸出液等，這些生物藥劑可以對(duì)多種食用菌病蟲(chóng)害起到一定的防治作用。