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    土壤中立枯絲核菌AG3菌核的熒光定量PCR快速檢測


    【發(fā)布日期】:2019-01-25  【來源】:菌物學報
    【作者】申永銘郭成瑾王喜剛沈瑞清陳愛昌胡小平
    【機構(gòu)】西北農(nóng)林科技大學植物保護學院旱區(qū)作物逆境生物學國家重點實驗室寧夏農(nóng)林科學院植物保護研究所甘肅定西市植保植檢站
    摘要:立枯絲核菌Rhizoctonia solani融合群3(anastomosis group 3,AG3)是引發(fā)馬鈴薯黑痣病的主要病原菌,嚴重威脅著馬鈴薯產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。菌核是馬鈴薯黑痣病菌在土壤中的主要存活結(jié)構(gòu),是馬鈴薯黑痣病的初侵染源,其密度直接影響馬鈴薯黑痣病的發(fā)病率和嚴重程度。為快速準確地檢測出土壤中菌核的密度,本研究以立枯絲核菌AG3轉(zhuǎn)錄間區(qū)(ITS)特異性引物RsTqF1/RsTqR1擴增產(chǎn)物的重組質(zhì)粒為標準品,構(gòu)建SYBR Green I實時定量PCR(q PCR)檢測體系,結(jié)合水篩法與Fast DNA?Spin Kit for Soil土壤DNA提取試劑盒對土壤樣品進行DNA提取,建立了循環(huán)域值(Ct)與土壤中立枯絲核菌AG3菌核密度的關系,并與傳統(tǒng)選擇性培養(yǎng)基篩選法進行比較。結(jié)果表明,實時定量PCR檢測靈敏度比常規(guī)PCR高10倍,土壤中菌核密度n(g/g土)和Ct值之間的關系為:n=10(9.6917‐Ct)/3.4558。相比較于選擇性培養(yǎng)基篩選法,水篩q PCR法能夠更加快速準確地檢測出土壤中立枯絲核菌的菌核密度。 
     
    基金:寧陜科技合作項目~~;
     
    關鍵詞:實時定量PCR; 水篩法; 馬鈴薯黑痣病;
     
     
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