香菇重組交換在基因組中的分布特征

易菇網(wǎng)訊  12月15日，華中農(nóng)業(yè)大學植物科學技術學院邊銀丙教授領銜的應用真菌研究團隊聯(lián)合中國農(nóng)業(yè)科學院麻類研究所在Journal of fungi（2020IF=5.816）上在線發(fā)表了題為“Chromosome-wide characterization of intragenic crossover in shiitake mushroom, Lentinula edodes”的研究論文，龔文兵副研究員為論文第一作者，肖揚副教授為通訊作者。該研究首次表征了香菇重組交換特征及其熱點分布，并對香菇重組交換變異進行了遺傳解析。

重組交換（crossovers，COs）是減數(shù)分裂的核心事件，亦是基因組進化和遺傳多樣性形成的關鍵驅(qū)動力之一，是育種的基礎。通過遺傳作圖研究重組交換，分析COs在基因組中的分布，了解重組熱點形成機制，挖掘調(diào)控重組變異的遺傳位點，有助于開發(fā)有效方法調(diào)控重組發(fā)生，打破育種的瓶頸。本研究利用香菇 F1 單核體群體的基因型數(shù)據(jù)，在全基因組水平對香菇的重組交換進行了表征，鑒定了884個COs，主要聚集于65個COs熱點區(qū)域，并分析了熱點區(qū)域的富集基序。隨后利用連鎖分析鑒定了調(diào)控不同類型重組交換變異的遺傳位點及候選基因，該結(jié)果有利于加深對大型真菌同源重組保守型與多樣性機制的認識水平。

該成果是團隊在香菇遺傳學研究領域取得的又一重要進展。今年3月和9月，團隊先后在Journal of Advanced Research (2020IF=10.479) ，Computational and Structural Biotechnology Journal (2020IF=7.271) 發(fā)表重要研究論文。相關研究獲得了國家自然科學基金、國家重點研發(fā)計劃和華中農(nóng)業(yè)大學自主科技創(chuàng)新基金等項目的資助。

文章鏈接：https://www.mdpi.com/2309-608X/7/12/1076