食用菌菌種退化是由于菌絲體的遺傳物質發(fā)生了變異而造成的。表現(xiàn)為菌種突然或逐漸喪失原有的生活力、豐產性能或部分子實體的形態(tài)改變。菌絲體生長緩慢，在培養(yǎng)基上出現(xiàn)濃密的白色扇形菌落，對環(huán)境條件如溫度、酸堿度、二氧化碳、氧氣、雜菌等抵抗力弱，子實體形成期提前或推后，出菇潮次不明顯等現(xiàn)象。

　　如何防止食用菌菌種退化呢？

　　1、保證菌種的純培養(yǎng)。不用被雜菌污染的菌種，不要用同一食用菌種類的不同菌株混合或近距離相連接培養(yǎng)。

　　2、嚴格控制菌種傳代次數，減少機械損傷，保證菌種活力。

　　3、適當低溫保存菌種。低溫型菌種(如蘑菇、香菇等)在4℃，高溫型菌種(如草菇)在16℃下保存，有利于保存菌絲體的活力。

　　4、避免在單一培養(yǎng)基中多次傳代，沿著合理的代次、母種、原種、生產種不同類型的培養(yǎng)基，有利于提高菌種活力和保持優(yōu)良性狀。

　　5、菌種不宜過長時間使用，超齡菌種會出現(xiàn)老化，而老化與退化是有機相連的，生活力弱的菌種很容易出現(xiàn)退化。

　　6、菌種要定期進行復壯，在適宜的溫度、合適的酸堿度、充足的氧量、適當漫射光、無雜菌培養(yǎng)等條件下進行。

　　7、每年進行孢子分離，以有性繁殖來發(fā)現(xiàn)優(yōu)良菌株，以組織分離來鞏固優(yōu)良菌株的遺傳特性。