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    粗皮側(cè)耳栽培種EST-SSR分子標(biāo)記的開發(fā)應(yīng)用及初級核心種質(zhì)庫的構(gòu)建


    【發(fā)布日期】:2019-01-18  【來源】:菌物學(xué)報
    【作者】張雪梅 姚強 宮志遠(yuǎn) 高興喜 李瑾 劉曉 韓建東 任鵬飛 萬魯長 任海霞
    【機構(gòu)】青島農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境研究所魯東大學(xué)菌物科學(xué)與技術(shù)研究院
    【摘要】根據(jù)已知的粗皮側(cè)耳、靈芝、香菇EST序列開發(fā)出9條粗皮側(cè)耳EST-SSR引物、58條靈芝EST-SSR引物和35條香菇EST-SSR引物,從中篩選出4條多態(tài)性好、條帶清晰的引物,對選取的185株粗皮側(cè)耳栽培種進(jìn)行擴(kuò)增分析。共擴(kuò)增得到59條帶,每個引物擴(kuò)增條帶數(shù)為12–19條,擴(kuò)增片段在100–1,100bp之間。根據(jù)擴(kuò)增結(jié)果構(gòu)建了一個含47株粗皮側(cè)耳栽培種的初級核心種質(zhì)庫P-core47。分析得出P-core47占原群體樣品數(shù)25%,占資源庫的13%,有效等位基因數(shù)和多態(tài)性位點占有率與原群體一致,多樣性指數(shù)均值比原群體高0.12747,在原群體的低頻率等位基因有所增強。P-core47內(nèi)菌株來源廣泛,基本已覆蓋各個栽培地區(qū),統(tǒng)計的質(zhì)量性狀和數(shù)量性狀均可在其中找到代表性菌株。表明了用EST-SSR分子標(biāo)記構(gòu)建粗皮側(cè)耳栽培種初級核心種質(zhì)庫的可行性。  
    【基金】國家食用菌產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)項目(No.CARS-24); 山東省優(yōu)秀中青年科學(xué)家科研獎勵基金:側(cè)耳栽培種核心種質(zhì)及其指紋圖譜庫的構(gòu)建研究; 山東省農(nóng)業(yè)良種工程項目(No.2011LZ006-04); 山東省科技發(fā)展計劃項目:基于宏基因組高通量測序的食用菌病害檢測與監(jiān)測技術(shù)及相關(guān)基因的研究; 農(nóng)業(yè)科技成果轉(zhuǎn)化資金項目:城郊食用菌產(chǎn)業(yè)化開發(fā);
    【關(guān)鍵詞】粗皮側(cè)耳; EST-SSR分子標(biāo)記; 初級核心種質(zhì)庫; 有效等位基因; 多態(tài)性位點;
     
     
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