羊肚菌科(Morchellaceae)包括可食用的羊肚菌和塊菌,以及其他不可食用的種類。羊肚菌被普遍認(rèn)為是腐生真菌,但由于缺乏系統(tǒng)的基因組比較和進(jìn)化分析,學(xué)界對其能否與植物形成生物營養(yǎng)關(guān)系存在長期爭議,且對其營養(yǎng)模式演化過程尚不明晰。
近日,中國科學(xué)院西北生態(tài)環(huán)境資源研究院聯(lián)合美國密歇根州立大學(xué)、日本沖繩科學(xué)技術(shù)大學(xué)院大學(xué)、美國勞倫斯伯克利國家實(shí)驗(yàn)室、美國能源部聯(lián)合基因組研究所、法國國家農(nóng)業(yè)食品與環(huán)境研究院(INRAE),對覆蓋全球羊肚菌主要譜系的高質(zhì)量基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行了深入分析,揭示了羊肚菌科腐生菌的基因組基礎(chǔ),以及羊肚菌科塊菌進(jìn)化為依賴于植物宿主營養(yǎng)的外生菌根生活方式的基因組特征。
研究表明,羊肚菌保留了完整的植物降解酶基因組庫,具備典型的腐生能力。相比之下,羊肚菌科的塊菌,如Leucangium spp.顯示出轉(zhuǎn)座元件富集、降解酶減少等與外生菌根共生真菌一致的基因組特征。同時(shí),研究發(fā)現(xiàn)羊肚菌主要是MAT1-1或MAT1-2異宗結(jié)合,但也有少數(shù)羊肚菌科物種是同宗結(jié)合。進(jìn)一步,研究指出羊肚菌或處于“腐-共生”連續(xù)體的中間區(qū)域。
該研究彌補(bǔ)了關(guān)于羊肚菌腐生能力及其與植物潛在生物營養(yǎng)關(guān)系長期存在的認(rèn)識(shí)空白,為學(xué)界理解土壤真菌營養(yǎng)模式的復(fù)雜演化提供了重要基因組證據(jù)。
相關(guān)研究成果以Pangeneric analyses reveal the divergent genome evolution and ecologies between morels and truffles in the Morchellaceae為題,發(fā)表在《當(dāng)代生物學(xué)》(Current Biology)上。研究工作得到國家自然科學(xué)基金委員會(huì)等的支持。
原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.cub.2025.07.037