【作者】楊馳 馬璐 肖冬來 應(yīng)正河 江曉凌 林衍銓
【機構(gòu)】福建省農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所 特色食用菌繁育與栽培國家地方聯(lián)合工程研究中心
摘要:用關(guān)鍵詞"DNA photolyase (pfam 00875)"和"FAD binding domain of DNA photolyase (pfam03441)"搜索廣葉繡球菌(Sparassis latifolia)閩繡1號菌株基因組,找到一個候選基因——隱花色素同源基因Slcry1,PCR擴增得到該同源基因cDNA全長1755 bp,基因組全長為2279 bp;利用PROTPARAM預(yù)測SlCRY1蛋白含有584個氨基酸,相對分子質(zhì)量為65800,等電點為8.94;利用SMART和Pfam預(yù)測其保守結(jié)構(gòu)域,發(fā)現(xiàn)SlCRY1蛋白(584個氨基酸)包含一個DNA光解酶(DNA Photolyase)結(jié)構(gòu)域和一個FAD結(jié)合(FAD binding)結(jié)構(gòu)域;用MEGA7軟件中的鄰位相連法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,發(fā)現(xiàn)SlCRY1屬于光解酶/隱花色素蛋白家族中的DASH(Drosophila,Arabidopsis,Synechocystis,and Homo species)型隱花色素;最后用熒光定量PCR檢測該同源基因在廣葉繡球菌不同發(fā)育階段及光照處理下的表達量:在約300 lx白色LED光照下,基因Slcry1表達量隨光照時間延長而增加;不同發(fā)育時期,Slcry1基因的表達水平為子實體>原基>菌絲。實驗結(jié)果揭示:SlCRY1屬于DASH型隱花色素,其表達量受到光照的誘導(dǎo),且隨廣葉繡球菌的生長發(fā)育而上升。
基金:福建省公益類科研院所專項(2016R1019-4); 福建省農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新團隊PI項目(2016PI-44); 福建省農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新團隊(STIT2017-1-6);
關(guān)鍵詞:廣葉繡球菌; 隱花色素; Slcry1; 食藥用菌;