【作者】李帆 陳利 丁艾 柳英 劉云超 閆苗 孫淑靜

【機構(gòu)】福建農(nóng)林大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院福建農(nóng)林大學(xué)(古田)菌業(yè)研究院

摘要：為了探討刺芹側(cè)耳子實體生長發(fā)育時期的基因表達(dá)變化,本文利用高通量測序技術(shù)對刺芹側(cè)耳不同發(fā)育時期(菌絲期、原基期、子實體時期)進(jìn)行RNA-Seq分析,在轉(zhuǎn)錄水平上解析差異表達(dá)基因在刺芹側(cè)耳生長發(fā)育過程中的作用和功能。KEGG功能富集顯示,菌絲期差異表達(dá)基因主要富集在碳代謝和氨基酸代謝中,其中三羧酸循環(huán)中編碼檸檬酸合酶、烏頭酸水合酶、異檸檬酸脫氫酶、琥珀酰輔酶A合成酶、琥珀酸脫氫酶、蘋果酸脫氫酶的基因表達(dá)量均上調(diào),說明碳代謝和氨基酸代謝是菌絲時期的主要能量來源;原基期上調(diào)的差異表達(dá)基因主要富集在脂肪酸代謝,其中RT-PCR定量結(jié)果顯示原基期編碼脂肪酸合酶的基因和編碼脂酰輔酶A合成酶的基因下調(diào),編碼超氧化物酶的基因和編碼過氧化氫酶的基因上調(diào),表明脂肪酸代謝和抗氧化酶對刺芹側(cè)耳原基期維持機體的穩(wěn)定和生物應(yīng)激方面起著重要作用。子實體時期上調(diào)的差異表達(dá)基因主要富集在剪接體、類固醇的生物合成以及AMPK信號通路中,說明環(huán)境因子對子實體時期有一定的影響。 

 

基金：福建省科技廳星火計劃(2016S0041)； 校科技創(chuàng)新專項基金(KFA17576A)； 福建省食用菌產(chǎn)業(yè)重大研發(fā)平臺(2014N2101)~~；

 

關(guān)鍵詞：刺芹側(cè)耳; 比較轉(zhuǎn)錄組學(xué); 不同生長發(fā)育時期; 差異表達(dá)基因; 代謝途徑;